aridmoors: (Default)
[personal profile] aridmoors
Немного о моем исследовании в биологии



Я занимаюсь исследованием протеина ACE2, который считается (пока) официально рецептором, который позволяет вирусу САРС-КоВ-2 проникать в клетки. С этим есть проблема. Для начала, наличие этого рецептора в клетках респираторного тракта ничтожно мало.

Например, данные мРНК:
Screen-Shot-2022-03-29-at-13-25-44

RPKM (слева, ось игрек) это количество РНК, найденное в образцах. Обратите внимание на левую вертикальную шкалу. Там цифры от 20 до 100 примерно. Это очень мало. Обычный протеин, как например актин альфа 1, показывает цифры в тысячах:

Screen-Shot-2022-03-29-at-13-27-37

Да, не везде, в смысле не во всех тканях. Да, по этому графику сложно что-то сказать, но можно сказать хотя бы то, что если у нас есть протеин, которого ДОх...Я, то он будет показывать RPKM значения в области тысяч, а не сотен, и тем более не десятков. Вообще значения секвенирования РНК до 20 - это в районе статистической погрешности.

Что мы видим на графике номер один? В легких значения около 1, это реально статистическая погрешность, не более. Там где 20, 30 - это уже в районе "ну может быть". Значения ниже 10 - реально в районе статистической погрешности.

Какие у нас есть доказательства тому, что протеин ACE2 вообще наличествует в респираторном тракте? Ну кроме вот таких РНК-данных, которые очень сомнительны, у нас есть гистохимия и иммуноокрашивание. Эти вещи ТОЖЕ говорят, что ACE2 крайне мало в респираторном тракте.

Screen-Shot-2022-03-29-at-13-38-08

Большинство антител не детектируют этот протеин в клетках, есть только одно антитело, которе что-то выдает, НО!

Антитела обладают такой пакостной фичей, как кросс-реактивность. Другими словами, они могут реагировать не на ваш протеин, а на чо-нибудь другое.

Есть способы выяснить, НА ЧО конкретно они реагируют.
И это очень надо в современных условиях, потому что коммерческих антител расплодилось дохрена, а насколько они реально детектируют ACE2 - хрен его знает, никто не проверял.

Я занимаюсь сейчас тем, чтобы отделить зерна от плевел. Во!!!!!!!!!! "Зерна от плевел!!" Это самое близкое к тому что мне сегодня сказал шеф на митинге с ним. Он сказал мне, что "сейчас так много статей про ковид, что ситуация... ээээ... как это по-английски... не знаю по-английски... короче 玉石混淆". Я сначала не поняла, чо он имеет в виду, потому что это "четверостишие", в смысле японское выражение из четырех иероглифов, которые вместе как пословица, но я ее не знала. Он сказал иероглифы, когда сказал иероглифы, стало понятнее.

Короче это "жемчуг и камни вместе перемешаны". Другими словами, у нас мешок, в котором куча камней и драгоценных камней, и они вместе перемешаны, вот такая ситуация. Это он сказал про современные исследования по ковиду. В смысле "тыкнешь статью - и фиг знает, то ли она хорошая, то ли фигня".

Вот да. Не знаю русского или английского выражения, соответствующего "玉石混淆". По-моему его нету.

Наиболее близко это "зерна и плевел", но в русском языке пословица есть только "отделить зерна от плевела", там нет сочетания что "О! Ух ты! Это у нас зерна и плевел вместе!"

А в японском есть.

В общем, я решаю задачу как отделить зерна от плевел.
Пока что.
Этого пока достаточно.

Кто мудрый и много знает, скажите
а) пословицу, точно соответствующую описанию "у нас куча зерен и плевел", "мы имеем ситуацию в которой куча зерен и плевел перемешаны" (玉石混淆)
б) это же самое или близкое по-английски.

Ну, лингвисты, напрягитесь.

Date: 2022-03-29 05:46 am (UTC)
From: [identity profile] aalitvin.livejournal.com
есть Евангельская притча, переведенная на все языки мира:

«Царство Небесное подобно человеку, посеявшему доброе семя на поле своем; когда же люди спали, пришел враг его и посеял между пшеницею плевелы и ушёл; когда взошла зелень и показался плод, тогда явились и плевелы. Пришедши же, рабы домовладыки сказали ему: господин! не доброе ли семя ты сеял на поле твоем? откуда же плевелы? Он же сказал им: враг человеческий сделал это. А рабы сказали ему: хочешь ли, мы пойдем, выберем их? Но он сказал им: нет, – чтобы, выбирая плевелы, вы не выдергали вместе с ними пшеницы, оставьте расти вместе то и другое до жатвы; и во время жатвы я скажу жнецам: соберите прежде плевелы и свяжите их в связки, чтобы сжечь их, а пшеницу уберите в житницу мою» (Мф.13: 25–30).

Date: 2022-03-29 05:53 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Это не решает проблему о том какая краткая пословица про семена ии плевела.

Date: 2022-03-29 06:04 am (UTC)
From: [identity profile] aalitvin.livejournal.com
все эти краткие пословицы имеют один указанный источник.

«Где Господь пшеницу сеет, там черт — плевелы»

Date: 2022-03-29 10:22 am (UTC)
From: [identity profile] rioken.livejournal.com

Может быть фразеологизмы такие как «всё смешалось в доме Облонских» или «смешались в кучу кони, люди»?

По крайней мере их слышуи употребляю в похожем смысле.

Date: 2022-03-31 02:14 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Хммм... нуууууу да, несколько. Но не совсем передает смысл.

Date: 2022-03-29 06:40 pm (UTC)
ext_472388: (Default)
From: [identity profile] drolya.livejournal.com

Мухи и котлеты.

Date: 2022-03-31 02:14 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Пока что это наиболее близко к японскому, да.

Date: 2022-04-02 05:34 pm (UTC)
From: [identity profile] kasanosaki.livejournal.com
точно, мухи и котлеты.

мы еще с друзьями говорим "отделить анусы от бонусов", но это наше внутреннее, не распространенное.

Date: 2022-03-31 11:09 am (UTC)
From: [identity profile] rbs-vader.livejournal.com
Мб, "вершки и корешки"?

Date: 2022-04-02 07:51 pm (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Не, вершки и корешки, во всяком случае в контексте той сказки, это когда одному одстается хорошее, другому плохое, причем там же еще мораль что типа один другого обманул (слабый перехитрил сильного).

Date: 2022-04-01 08:04 am (UTC)
From: [identity profile] gateya.livejournal.com
Иголка в стоге сена

Date: 2022-04-02 07:53 pm (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Не, не то. Искать иголку в стоге сена - это искать что-то. Это не когда "перемешаны камни и жемчужины в одном мешке".

Date: 2022-04-24 09:37 pm (UTC)
From: [identity profile] protey-009.livejournal.com
А какую биологическую роль выполняет рецептор ACE-2?

Profile

aridmoors: (Default)
aridmoors

January 2026

S M T W T F S
    123
45678910
11121314151617
18192021222324
25262728293031

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 20th, 2026 07:08 pm
Powered by Dreamwidth Studios