aridmoors: (Default)
[personal profile] aridmoors
У меня новая работа!!!!
То есть она у меня была новая с начала сентября, но у меня теперь другие условия, чем обычно, гораздо более клевые с налогооблагательной точки зрения и точки зрения здоровья и балансировки работы и личной жизни: я теперь имею неограниченное количество выходных, они не оплачиваются, но мне стоит только захотеть и согласовать с начальством, что я не хочу работать тогда-то и тогда-то, и без проблем я могу отдыхать сколько угодно, не выгонят, давления вообще нет. И я первую часть сентября отдыхала по причине того, что слишком жарко и я не могу. А теперь я начала работать, разогналась, мне очень интересно, и вообще тьфу-тьфу-тьфу всё очень клёво.

Так вот. Я вообще-то всегда плелась в хвосте новых технологий, например мой первый смартфон я купила исключительно в связи с переездом в Швейцарию, если бы не переезд, я бы сидела на раскладушке до последнего, я не любила смартфоны и не хотела их, но в Швейцарии мне потребовался новый телефон, и в магазине были только смартфоны, а в Швейцарии без машины же тупик (как и в Японии собственно), то есть раз потратил день, приехал в магазин - надо уйти оттуда с покупкой, а то зря мотался. Ну и я там купила свой первый смартфон, сначала мини-самсунг. После примерно двух недель с этой мини-штукой я поняла, что мои надежды (что я смогу носить его в кармане рубашки или в заднем кармане джинсов) не оправдали себя, и меня бесил маленький экран, так что я ударилась в другую крайность - купила смартфон с самым большим экраном (на тот момент это был первый гугло-макро-смартфон, т.е. я уже так прилично отставала от всего остального мира золотого миллиарда в плане освоения смартфонов) - короче с тех пор я как вот купила первый свой макро-смартфон от гугла, так я и сейчас продолжаю в том же духе. В Японии при обратном переезде купила новый на замену швейцарскому (и то в связи с переездом опять же), а потом я его через 3,5 года посеяла неизвестно где, и пришлось купить новый, и опять я вот тоже - гугло-макро-смартфон. И с тех пор не меняла. Короче все уже поняли, что я не люблю новые технологии.

Но чатГоПоТы мне почему-то как-то зашел. Я даже не знаю почему. Наверное потому что в отличие от физических технологий, чатГоПоТы - это программа. Вот с программами в компьютере у меня совершенно другие отношения. Я люблю устанавливать и переустанавливать и настраивать Линукс, я люблю искать как решить какую-то программерскую задачу (хотя я, естественно, в подметки не гожусь мужу в этом, но он же не может на каждый мой чих подскакивать, я сначала сама должна попытаться решить) - короче с программами почему-то совсем по-другому. Ну и короче я начала с бесед с этим чатом, много нового просто в беседе за жизнь он сказать не мог, но я начала его использовать и в работе. Например, было такое. Мне сестра пишет: "можешь проверить вот этот документ, там испанский правильный?". Ну я такая думаю сразу:
"А чо я буду проверять, пусть вон чатГоПоТы проверит, он же должен это уметь".
Ну проверила чатом. Правильно всё. Перепроверила руками сама. Правильно всё. Пишу сестре:
- Дак ты это. Чо ты у меня спрашиваешь, на будущее если будет такой вопрос, загони его в чатГоПоТы, он нормально справляется с таким сейчас.
Она пишет:
- А, о, а мне даже в голову не пришло че-то.
Ну вот, а мне пришло.

А сегодня у меня был первый серьезный разговор с начальником на тему того, что мне надо сделать, и начальник сказал, что он хочет, чтобы я ему сделала Индуцированные Плюрипотентные Стволовые (ИПС) клетки, которые можно дифференцировать в нервные клетки. Ну в Японии продажей ИПС-клеток занимается одна контора, и вот я зашла к ним на сайт, поискать чо есть в продаже. И на мой запрос - "сколько у вас ИПС-клеток от здоровых индивидуумов" - вывалилось аж 1094 результата. Я открыла один, открыла второй, и поняла, что руками тут искать такие клетки, которые можно дифференцировать в нервные, я буду до когда петух на горе свистнет.

И у меня как-то сразу, сама по себе, возникла идея, что я хочу попросить чатГоПоТы поискать мне на этом сайте клетки, подходящие мне по таким-то и таким-то параметрам.
ОН КЛАССНО СПРАВЛЯЕТСЯ С ТАКОЙ ЗАДАЧЕЙ!!!!!!!!!

Ну грубо говоря, если вам надо скажем, не знаю, дрон купить для какой-то цели с какого-то определенного сайта. Вполне можно загнать запрос в чатГоПоТы, попросив его "поищи на таком-то сайте и оттуда найди мне дрон для таких-то и таких-то целей, укажи при выдаче результата то-то и то-то".

Я так скажу. ДО ЭТОГО ДНЯ я с чатомГоПоТы общалась только про "за жизнь", и я даже не знала, что оказывается он может тормозить с ответом. А вот когда я его подключила к своей научной работе, он мне начал выдавать - "думаю... думаю... 28 секунд ушло на думание, вот результат". Он оказывается может хорошо искать когда надо найти иголку в стоге сена. Главное указать на стог и охарактеризовать иголку. Короче это такой поисковик на стероидах. Я бы это так описала, больше всего именно так.

Короче вот. Я прям с пользой провела день. Если бы еще я научилась писать код с его помощью и автоматизировала процесс анализа данных с видеосъемки мышей - мой начальник бы души во мне не чаял бы, ящитаю. Есть куда расти.

!!!
:)

Date: 2025-09-19 10:43 am (UTC)
From: [identity profile] lj-frank-bot.livejournal.com
Здравствуйте!
Система категоризации Живого Журнала посчитала, что вашу запись можно отнести к категориям: Техника (https://www.livejournal.com/category/tehnika/?utm_source=frank_comment), Технологии (https://www.livejournal.com/category/tehnologii/?utm_source=frank_comment).
Если вы считаете, что система ошиблась — напишите об этом в ответе на этот комментарий. Ваша обратная связь поможет сделать систему точнее.
Фрэнк,
команда ЖЖ.

Date: 2025-09-19 11:24 am (UTC)

Date: 2025-09-19 11:46 am (UTC)

Date: 2025-09-19 11:51 am (UTC)

Date: 2025-09-19 12:38 pm (UTC)
From: [identity profile] p2004r.livejournal.com

А что надо с мышами? "Трекать" их? Или какие то "позы" распознавать? Можно ли на них маркеры (маленькие) клеить?

Date: 2025-09-19 01:47 pm (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Ну грубо говоря нормальные мыши двигаются по новому квадрату не так, как "больные" (мыши с вышибленным геном) мыши. Соответственно нам надо распознать и охарактеризовать разницу в движениях обычной мыши от больной мыши (exploratory behavior).

До сих пор это делается руками постдоками. Надо сделать модель машинного обучения, чтобы компьютер выучил как двигаются нормальные мыши, и смог бы выявить отличия от больных мышей. Ну их движение по квадрату будет разным, в смысле оно по факту разное, уже известно, но так как не автоматизировано, то грубо говоря сидит несчастный чел и наблюдает за ними вручную. За собственно икс-игрек координатами.

Date: 2025-09-19 02:29 pm (UTC)
From: [identity profile] p2004r.livejournal.com

DeepLabCut (DLC)
Фреймворк на Python для маркерлесс-трекинга поз любых животных.

  • Как работает:

    1. Вы размечаете вручную небольшое количество кадров из вашего видео (например, 200), указывая, где находятся нос, уши, лапы и т.д.

    2. DeepLabCut на основе этих данных обучает нейронную сеть (ResNet или MobileNet).

    3. Обученная модель автоматически находит те же точки на тысячах других видеокадров с высокой точностью.

  • Плюсы:

    • Универсальность: Работает с мышами, крысами, рыбами, насекомыми, птицами — чем угодно.

    • Высокая точность: Дает координаты X, Y для каждой точки с субпиксельной точностью.

    • Огромное сообщество: Множество туториалов, статей и готовых решений.

  • Минусы:


    Требует времени на разметку данных. Для обучения модели нужна мощная видеокарта (NVIDIA GPU)



    Идеально для: Анализа походки, сложных движений, социальных взаимодействий одного или нескольких (но хорошо различимых) животных.

  • SLEAP (Social Leisurely Encoding of Animal Pose)


    • Что это: Система для трекинга поз нескольких животных одновременно, даже если они выглядят абсолютно одинаково.

    • Ключевое отличие от DLC: SLEAP лучше справляется с ситуациями, когда животные перекрывают друг друга. Он умеет не только находить части тела, но и правильно соотносить их с конкретной особью, сохраняя ID каждого животного.

    • Плюсы:

      • Лучший в классе для мульти-трекинга: Превосходно отслеживает группы животных.

      • Удобный GUI: Имеет очень продуманный интерфейс для разметки и коррекции данных.

      • Активно развивается и предлагает передовые алгоритмы.

    • Минусы:

      • Может быть несколько сложнее в освоении, чем DLC для простых задач.

    • Идеально для: Исследований социального поведения, агрессии, ухаживания, иерархии в группе.

    Anipose


    Это не совсем самостоятельный трекер, а надстройка над DeepLabCut для 3D-анализа.

    • Что это: Инструментарий для калибровки нескольких камер и триангуляции 2D-координат (полученных из DLC) для получения 3D-позы животного.

    • Плюсы:

      • Позволяет получить полноценную трехмерную модель движений.

      • Относительно простая калибровка с помощью шахматной доски.

    • Идеально для: Изучения биомеханики, сложных моторных навыков (например, как крыса берет еду лапой).

    Инструменты для анализа поведения (на основе данных о позе)


    Эти пакеты берут данные из DLC или SLEAP и помогают автоматически классифицировать поведение.


    1. SimBA (Simple Behavioral Analysis)

    • Что это: Платформа с графическим интерфейсом, которая позволяет на основе координат ключевых точек (из DLC) обучать классификаторы поведения.

    • Как работает: Вы подаете на вход видео и трекинг-данные. Затем размечаете короткие клипы с поведением (например, "груминг", "атака", "замирание"). SimBA обучает модель машинного обучения (например, Random Forest) распознавать это поведение на новых видео.

    • Плюсы:

      • Снижает порог входа в автоматическую классификацию поведения.

      • Удобный интерфейс, не требует глубоких знаний в программировании.

    • Идеально для: Скрининга эффектов лекарств, фенотипирования, когда нужно посчитать частоту и длительность конкретных действий.

    2. B-SOiD / MARS


    Это более продвинутые системы для неконтролируемой (unsupervised) классификации поведения. Они не требуют ручной разметки, а сами находят в данных повторяющиеся паттерны движений ("слоги" поведения). Это мощный инструмент для поисковых исследований.




    Date: 2025-09-19 02:30 pm (UTC)
    From: [identity profile] p2004r.livejournal.com

    Если вам не нужно отслеживать отдельные части тела, а достаточно просто траектории движения в стандартных тестах (открытое поле, приподнятый крестообразный лабиринт), есть и более простые инструменты.


    1. Bonsai

    • Что это: Визуальный язык программирования для обработки потоковых данных в реальном времени. Это не просто трекер, а целый комбайн для управления экспериментами.

    • Как работает: Вы строите пайплайн из готовых блоков: "получить кадр с камеры" -> "преобразовать в серое" -> "найти контур объекта" -> "записать координаты".

    • Плюсы:

      • Работа в реальном времени: Идеально для экспериментов с обратной связью (closed-loop), когда нужно что-то сделать (включить свет, подать звук) в ответ на поведение животного.

      • Гибкость и модульность.

    • Минусы:

      • Требует времени на освоение своей "визуальной" логики.

    Date: 2025-09-19 02:31 pm (UTC)
    From: [identity profile] p2004r.livejournal.com

    Коммерческий "Золотой стандарт"


    Стоит упомянуть и коммерческого лидера, чтобы понимать, с чем сравнивать.

    • Noldus EthoVision XT: Это самый известный коммерческий софт. Он делает всё: отслеживает (и по центру масс, и по точкам), анализирует, строит графики, управляет оборудованием. Главный минус — очень высокая цена.

    Date: 2025-09-19 02:32 pm (UTC)
    From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
    Огромное спасибо!!!!

    Я щас возьму паузу чтобы всё это понять.

    Если не возражаете, может быть спрошу что-нибудь опять.

    Спасибо!!!!!!!

    Date: 2025-09-19 01:02 pm (UTC)
    From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
    У него же режимы переключаются.

    Date: 2025-09-20 09:30 am (UTC)
    From: [identity profile] levgilman.livejournal.com
    Я про это:

    ДО ЭТОГО ДНЯ я с чатомГоПоТы общалась только про "за жизнь", и я даже не знала, что оказывается он может тормозить с ответом. А вот когда я его подключила к своей научной работе, он мне начал выдавать - "думаю... думаю... 28 секунд ушло на думание, вот результат". Он оказывается может хорошо искать когда надо найти иголку в стоге сена.

    У него есть мгновенный и мыслящий режим. И разница между ними в скорости, вот без соотнесения с этими режимами и непонятно, что произошло в случае, который Вы описываете.
    Впрочем, у меня платная версия, а бесплатную в анонимной вкладке посмотреть не могу, регистрации требует.

    Я не имел в виду возражения на то, что он чего-то не может

    Date: 2025-09-19 01:54 pm (UTC)
    From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
    В смысле можно его попросить сверить данные обычной мыши и больной мыши? Вряд ли такой результат будет надежным. Мне так кажется. Я могу конечно проверить. Но он в целом плохо жрет большой объем данных и еще хуже делает из него выводы. Не. ИИ и машинное обучение - это все-таки разные вещи.

    Я плохо разбираюсь? Объясните мне, буду ПРЕМНОООООГО благодарна!!!

    Date: 2025-09-19 02:15 pm (UTC)
    From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
    Он отказывается сравнивать два эксель документа на основании машинного обучния в смысле паттернов. В смысле он может их сравнимвать в плане поячейково, но это ни о чем. Он отказывается "выучиться паттерну поведения мышей" и потом сравнить с больными мышами.

    Date: 2025-09-19 01:12 pm (UTC)

    Date: 2025-09-19 01:12 pm (UTC)

    Date: 2025-09-19 01:56 pm (UTC)

    Date: 2025-09-19 02:09 pm (UTC)

    Date: 2025-09-19 03:28 pm (UTC)

    Date: 2025-09-19 04:25 pm (UTC)

    Date: 2025-09-19 06:33 pm (UTC)

    Date: 2025-09-20 03:06 am (UTC)

    Date: 2025-09-20 06:25 am (UTC)

    Date: 2025-09-20 05:55 pm (UTC)

    Date: 2025-09-20 06:10 pm (UTC)
    From: [identity profile] snake-d-ha.livejournal.com

    От просто отлично разбирает нечеткие данные, в том числе видео.
    Но и любую аналитику.
    Я буквально бросаю ему скриншоты и прошу свести в таблицу — делает за секунды.

    Date: 2025-09-20 09:07 pm (UTC)

    Date: 2025-09-21 12:59 am (UTC)
    From: [identity profile] ploughlike-elk.livejournal.com

    когда я его подключила к своей научной работе, он мне начал выдавать - "думаю... думаю... 28 секунд ушло на думание, вот результат"

    Это что, я вон ему задал такую задачку что он думал аж почти три минуты. И все равно ответ содержал ошибки. А потом еще минуту он генерировал картинку для иллюстрации и там уже совсем напорол фигни.


    Date: 2025-09-21 01:10 am (UTC)
    From: [identity profile] ploughlike-elk.livejournal.com

    Советую подписаться на платную версию, она работает заметно лучше. У меня в работе ИИ используется постоянно и свою стоимость месячной подписки отбивает буквально за день-другой.



    Там еще есть режим Deep research, но я им пользовался только один раз чисто из любопытства и не могу пока сказать насколько там есть разница по качеству результатов.

    Также есть возможность скачать полный архив всех своих разговоров с системой.

    Date: 2025-09-21 07:52 am (UTC)

    Date: 2025-09-21 01:43 pm (UTC)

    Date: 2025-09-24 02:40 pm (UTC)

    Date: 2025-09-26 03:16 am (UTC)
    From: [identity profile] Последний Из-Марсиан (from livejournal.com)
    Image

    Date: 2025-09-27 01:44 am (UTC)

    Profile

    aridmoors: (Default)
    aridmoors

    January 2026

    S M T W T F S
        123
    45678910
    11121314151617
    18192021222324
    25262728293031

    Style Credit

    Expand Cut Tags

    No cut tags
    Page generated Jan. 20th, 2026 12:05 pm
    Powered by Dreamwidth Studios