силии

Jun. 1st, 2017 12:52 pm
aridmoors: (Default)
[personal profile] aridmoors
Ой, мне сказали что коммент слишком длинный и я не могу опубликовать. Вынесу в пост!


Оооо, силии я обожают и могу говорить про них часами)))) Они не моя центральная тема, я их просто очень люблю и постоянно ими занимаюсь в качестве подсобных бэк-ап проектов. С силиями такая фигня, что в общем сначала они были открыты как бесполезные отростки, и считались ненужными, впроде как аппендикс когда-то. А потом был открыт ежовый сигнальный путь (Hh), и выяснилось, что компоненты этого пути находятся в силиях, и без силий этот сигнальный путь не работает. Тогда возникла гипотеза, что силии - это такие антенны. Которые участвуют в сигнализаровании. Народ стал искать, а не находятся ли другие компоненты других сигнальных путей в силиях? Но кроме ежового ничего до сих пор найти не может!

То есть они изо всех сил продолжают искать и высасывают из пальца разные аргументы, что силии участвуют в разных сигнальных путях (таких статей сейчас вышло уже тысячи, что "силии регулируют то-то и то-то") - но ни один из этих и близко не стоит к ежовому. С ежовым там всё очень понятно: компоненты локализуются прямо в силию, там внутри происходит их обработка, а если силии удалить, то эта обработка происходит не будет, и всё сломается. И когда силии удаляют у мышей, то эмбрионы гибнут именно потому, что ежовый пасвэй не работает. В первую очередь. Ни для одного другого сигнального пути подобного эффекта нет.

Но гипотеза того, что силии - это антенны, все равно сохраняется по сей день. Более того, поскольку народ активно пишет статьи, что силии "участвуют тут и там", то в эту гипотезу начинает верить все больше и больше народу. Хотя никаких крупных доказательств, кроме ежового пасвэя, до сих пор нет. Более того, существуют мыши, у которых силии были удалены только в тех клетках, где нет ежового пасвэя, и никаких проблем у этих мышей нет! Т.е. нет фенотипа. Ну или он есть, но не заметен. А силии, между тем, существуют во всех клетках! Абсолютно всех, кроме жировых и крови.
Поэтому вот для меня лично это загадка: что же они там делают, а? Там же нет ежового пасвэя.

Ответить на этот вопрос точно можно только одним способом: выяснив молекулярный состав силий. Вот если бы мы знали точно, ЧТО есть внутри силий, мы бы сразу могли сказать, какова их функция. Например, если мы там обнаружили бы юбиквитиназы, то мы бы знали, что там происходит юбиквитинирование какого-то протеина, которое должно быть по времени приурочено к существованию силий в клетке. Это стандартный принцип компартментализации. Что-то должно происходить где-то, чтобы оно было по времени и пространству к чему-нибудь приурочено. То есть если бы мы знали состав силий, все было бы значительно проще.

Однако! Состав силий определить до сих пор никому не удавалось. Долгое время силии пытались оторвать руками (точнее, наконечником пипетки - всосать и оторвать, patch clamp кто в теме), потом это удалось одной команде, они опубликовались в нейчер, и опубликовали состав оторванной силии. Однако в этом исследовании была огромная проблема: они оторвали силию "с мясом". То есть с центросомой, и со всем, что там на центросоме налипло соответственно. А это, сами понимаете, не то что нам нужно. На центросому там пол-клетки налипнет, тока дай.

Другие группы центрифугировали клетки и получали осадок из оторвавшихся силий, однако и в этом случае силии отрывались с мясом! Что кстати тоже интересно - значит, миктротрубочки внутри силиий прочнее, чем микротрубочки, идущие от центросом внутрь клетки - т.к. центросомы всегда вырываются с мясом.

Эти команды опубликовали протеомы силий и разные другие анализы, но в тех анализах присутствовало все, угодно, вплоть до РНК. И сказать, насколько это действительно относится к функции силий, не представлялось возможным.

И до сих пор ни один человек на свете не смог оторвать или отрезать только кончик силии, чтобы выяснить наконец, что в нем находится БЕЗ контаминации посторонним налипшим на центросоме материалом. И мы, увы, не можем наверняка сказать, какие на самом деле функции у этой таинственной органеллы, которая то ли антенна, то ли гигантский ус, и которая присутствует везде, но не дает фенотипа при удалении ее из большой части клеток во взрослых мышах.

Вот!!!

Date: 2017-06-01 04:02 am (UTC)
From: [identity profile] molchun22ru.livejournal.com
ничего не понятно :) пишите исчё :)

последнее время, так получается, часто спрашиваю (тех, кто фантастику читает).
астровитянку читали? обязательно обе, первые две книги.
http://fantlab.ru/work116159 (на сайте и описание и ссылка на книги)
и если читали, какое впечатление?

силии

Date: 2017-06-01 04:04 am (UTC)
From: [identity profile] livejournal.livejournal.com
User [livejournal.com profile] molchun22ru referenced to your post from силии (http://molchun22ru.livejournal.com/348574.html) saying: [...] Оригинал взят у в силии [...]

Date: 2017-06-01 06:22 am (UTC)
From: [identity profile] tari-bird.livejournal.com
Такое ощущение что заглянула в маленькое окошко в реакторный машзал

Date: 2017-06-01 09:13 am (UTC)
From: [identity profile] strukturnyj-elf.livejournal.com
Силии не гуглятся на русском от слова совсем. Сделайте небольшой ликбез: что это вообще такое. Понятно что какие-то отростки, но больше ничего не понятно.

Date: 2017-06-01 09:46 am (UTC)
From: [identity profile] strukturnyj-elf.livejournal.com
Погуглил, нашёл. Но хозяйка журнала пишет, что вопрос тоньше и можно найти не совсем то.

Date: 2017-06-01 09:52 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Ну в английском там тоже следу этой путаницы остались, раньше словом cilia обозначали и подвижные, и неподвижные силии.
Для полного понимания надо гуглить primary cilia. Это вот то о чем речь.

Date: 2017-06-01 09:54 am (UTC)
From: [identity profile] strukturnyj-elf.livejournal.com
Угу. В английской википедии всё в одну статью свалили.

Date: 2017-06-01 06:00 pm (UTC)
From: [identity profile] kaktus-okamenel.livejournal.com
...В романе Силии Бишоп испанский конкистадор и искатель приключений Панфило де Замакона проникает...
:)

Date: 2017-06-01 09:38 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
:)

Это cilia, на русском они коряво переводятся словом "реснички", но это совсем неправильно. Дело в том, что раньше все маленькие отростки считали одинаковыми, т.е. существовало только одно слово и для усиков жгутиковых, и для ресничек на теле ресничных червей, и для "ресничек" на поверхности клеток трахеи, и для силий.
В зарубежной науке, слава богу, уже определились и поняли, что ничего общего между ресничками ресничных червей и ресничками на теле клеток трахеи нет, и нет также ничего общего между отростками на клетках трахеи (в википедии в статье "реснички" как раз на фотке они показаны - такие черно-белые кусты, много штук) и СИЛИЯМИ.
Но в русском языке до сих пор нет нормального термина для этих разграничений. Поэтому я и говорю: силии. На английском они произносятся "силии", поэтому я просто их так и называю.

Ну, или в крайнем случае можно говорить "цилии", как в википедии написано в статье "реснички", но дело в том, что силии - это не реснички. Реснички - это совсем другая вещь, и фотка в википедии сбивает с толку, потому что это фотка совсем других структур, в смысле не цилий (не силий).

Силии, во-первых, одиночные, всегда растут по одной штуке на клетку. А во-вторых, они внутри совершенно по-другому устроены (с точки зрения скелета).
Их фотка вот:
http://biol1020-2012-1.blogspot.jp/2012/05/ciliopathies.html

Date: 2017-06-01 09:43 am (UTC)
From: [identity profile] strukturnyj-elf.livejournal.com
Премного благодарен

Date: 2017-06-01 02:02 pm (UTC)
From: [identity profile] uxus.livejournal.com
Ну всё-таки "цилии" гораздо понятнее.

Date: 2017-06-01 10:48 pm (UTC)
From: [identity profile] aosypov.livejournal.com
Потому что корень латинский и привычен уху с латинским "ц", а англичане "ц" не умеют, говорят вместо него "с".

Date: 2017-06-01 10:25 pm (UTC)
From: [identity profile] sciuro.livejournal.com
Фотка-то хороша, а вот в тексте опять путаница, потому что автор пишет что Ciliopathies, as mentioned, are genetic disorders, which are dictated by the behaviour and growth of a relatively novel organelle known as the primary Cilium - а ведь эти ciliopathies как раз включают в себя тонну синдромов, связанных с проблемами ресничного эпителия - тот же синдром Картагенера, например, который для полного запутывания называется "primary ciliary dyskinesia", но primary тут относится не к cilia, а к дискинезии - то есть "первичная дискинезия ресничек", а не "дискинезия первичных ресничек". Черт ногу сломит! Но при СК обычно двигательный аппарат факапнут очевидным образом, динеин, кажется.

А вот если лазером отжечь клетку и оставить только цилию - это нельзя?

Date: 2017-06-01 10:57 pm (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Да, я настолько привыкла к этим текстам, что путаницы этой уже не замечаю, но вы правы, действительно.

Лаааазером... не знаю. Наверное можно, но... затрахаешься? По одной-то.
Я тоже уже думала над этим много, но пока не могу придумать ничего внятного. Действительно, как кончик отрезать?

Date: 2017-06-01 11:22 pm (UTC)
From: [identity profile] sciuro.livejournal.com
Ну если на вестерн нааковыриввать, то затрахаешься однозначно :) а всякие single cell proteomics может и ничего? Как в том анекдоте про ведро кильки и бутерброд с чёрной икрой :)

Date: 2017-06-01 09:33 am (UTC)
From: [identity profile] scholarpunk.livejournal.com
Гггааа! Да, правильно тут народы говорят - не гугляццо.

Я тоже не понимал ничего, пока про центросому речь не зашла.

Это ciliae, я так понимаю?.. Жгутики, тобишь ворсинки.

И как это, извиняюсь, аппендикс?.. Как вообще без мерцательного эпителия существовать?! Дыхательные пути, часть мочеполового тракта, евстахиевые трубы с барабанными полостями (да и, кстати рецепторы слуховой и вестибулярный сами из чего состоят, а?), канал спинного мозга с желудочками головного, ну и там всякая мелочь навроде слезных и семявыводящих протоков... Хорош аппендикс!

Edited Date: 2017-06-01 09:38 am (UTC)

Date: 2017-06-01 09:44 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Нееееет!!!!!!!! ААААА!!!

Вот, я уже попыталась объяснить человеку выше. Жгутики, то бишь ворсинки, они же реснички - это совсем не силии, это вообще никакого отношения к силиям не имеет!

Ворсинки - это ворсинки. Это, как я понимаю, то, что растет на эпителии клеток трахеи. Это эти кусты из википедии, они там сфотаны в статье "реснички".

А силии - это одиночные структуры! Они называются по-английски primary cilia, и растут всегда по одной штуке на клетку! И у них совсем другая химия, чем у этих которые растут кустами! Те, которые растут кустами - они как раз вот как вы и написали, нужны чтобы двигать жидкость, для слуха, для фаллопиевых труб и так далее. А primary cilia - они неподвижные! Они ничего не двигают и они вообще по одной штуке на клетку!

В русском языке в русской науке к сожалению по этому вопросу полная отсталось, так что даже вот слова нормального нет, т.е. даже разговаривать на эту тему невозможно - нечем. Термина нет.

Date: 2017-06-01 09:59 am (UTC)
From: [identity profile] strukturnyj-elf.livejournal.com
А гугл-переводчик решил, что на русском это слово должно писаться "килия" :))

Date: 2017-06-01 10:25 am (UTC)
From: [identity profile] scholarpunk.livejournal.com
А, так бы сразу и сказали. И почему же в русском нет, есть в русском! На то всегда нам нужен переводчик Multitran!

"Первичная ресничка" называется. И в отечественной науке тоже, вот, с первого раза нашелся обзор Только памойму она больше по химическим делам. Кальций там, то -сё..

Date: 2017-06-01 11:27 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
А, во, точно, спасибо. Ну буду теперь знать что в отечественной науке принято ее называть "первичная ресничка".

Date: 2017-06-03 12:20 pm (UTC)
From: [identity profile] nsela.livejournal.com
Вот, интересно, между обычной и первичной ресничкой есть сходство? Центриоли в основании, наверное. О внутреннем строении обычной реснички почему больше знают? Их тоже, небось, оторвать нельзя. Эти центриоли в основании той и другой , они какие то разные? Как центриоли вообще отпочковываются от клеточного центра и направляются к плазмалемме? Особенно у инфузорий, как напастись центриолями?

Date: 2017-06-01 10:54 am (UTC)
From: [identity profile] nil-0.livejournal.com
А можно по-простому для физиков:
1) Что такое силии? Жгутики?
2) Что такое ежовый сигнальный путь? Вроде как-то регулирует деление и дифференцирование клеток?

Date: 2017-06-01 11:30 am (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Во, мы нашли с человеком в комментах, что они в отечественной науке называются "первичные реснички"!

Ежовый сигнальный путь это hedgehog pathway, он участвует в дифференциации клеток, но у него роль сильно зависит от контекста (химического). Например, в раковых клетках его активация связана с плохим прогнозом, т.е. он дает раковым клеткам более агрессивную природу.
Тоже кстати не знаю как этот сигнальный путь называется по-русски.

Date: 2017-06-01 11:40 am (UTC)
From: [identity profile] vadperez.livejournal.com
понятно.
А они покрыты мембраной? Если нет - то нельзя ли их "сбрить" ферментами? там, конечно, будет тоже много всего левого, но силии по отдельности вроде должны быть. нет?

Date: 2017-06-01 12:06 pm (UTC)
From: [identity profile] aridmoors.livejournal.com
Они покрыты мембраной, но к сожалению эта мембрана составляет одно целое с клеточной мембраной. Там у основания силии просто барьер какой-то, который не допускает перетекания содержимого, но сама мембрана прям продолжение клеточной.

Date: 2017-06-01 02:56 pm (UTC)
From: [identity profile] vadperez.livejournal.com
мда, задачка сложна технически.
Как вариант могу предложить выкорчевывать с корнем и потом "сбривать" корень ультразвуком, например. будет конечно - одна пипетка на силию...
Или лазерную аблацию- Тоже поштучно...
И, видимо, на фиксированных клетках - чтобы ничего не улетело.
Антенна-то антенна, но мне кажется, механочувствительность на уровне клетки действует по-другому, нежели мы ее воспринимаем. Все ведь клетки имеют механочувствительность, но у нас еще и специальные рецепторы для механочувствительности на макроуровне есть...
А у меня по своим экспериментам с кое каким индикатором вышло, что даже ХиЛа чувствует когда ее поливают питательной средой (там еще много контролей надо провести)

Date: 2017-06-01 10:42 pm (UTC)

Date: 2017-06-03 02:59 am (UTC)
From: [identity profile] sciuro.livejournal.com
Закон парных случаев - еще вчера утром я вообще про силии ничего не знала, вечером прочитала ваш пост, а сегодня в фейсбуке приятель пишет, что у него вышла про силии статья в JBC :)))
From: (Anonymous)
Наконец то нашел сайтец где возможно заказать Айфон 7-ой по доступной стоимости 6990 рубликов, торопитесь раскупают моментально. приобрести можно тут - http://bit.ly/2rFkTWy

New Poke out

Date: 2017-06-07 12:15 am (UTC)
From: (Anonymous)
My revitalized number
http://pattaya.girls.blogporn.in/?entry-alanna
caged dancer flirt talaq pittsburgh

Tour in Verona.

Date: 2017-08-24 01:54 pm (UTC)
From: (Anonymous)
“Adoro viaggiare in Segway”. Il modo migliore per cadere in amore con Verona in nessun tempo!
Quando si dispone di un breve tempo a coprire una citta, questo e un ottimo modo per farlo. Mi e piaciuto molto il nostro tour e guida. L'audio e stato un po' difficile, ma la guida li ha tenuti lavorando. Quando il suo caldo, questo e un ottimo modo per andare in giro e stare un po' fredda. Verona e una citta facile accesso per segway intorno. Abbiamo visto tutti i principali siti e ci hanno dato una buona sensazione per il layout della citta. Siamo stati in grado di tornare a pochi posti il giorno successivo per un po' di tempo.

https://www.regiondo.it/segway-historic-tour-in-verona

[b]Book Now[/b] ''' http://segwayverona.com/

https://eu5.bookingkit.de/onPage/detail?e=2202759fc95947e409b3435a7ae87161&preview=true&lang=it

Profile

aridmoors: (Default)
aridmoors

January 2026

S M T W T F S
    123
45678910
11121314151617
18192021222324
25262728293031

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 20th, 2026 10:30 pm
Powered by Dreamwidth Studios