![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
Ой, мне сказали что коммент слишком длинный и я не могу опубликовать. Вынесу в пост!
Оооо, силии я обожают и могу говорить про них часами)))) Они не моя центральная тема, я их просто очень люблю и постоянно ими занимаюсь в качестве подсобных бэк-ап проектов. С силиями такая фигня, что в общем сначала они были открыты как бесполезные отростки, и считались ненужными, впроде как аппендикс когда-то. А потом был открыт ежовый сигнальный путь (Hh), и выяснилось, что компоненты этого пути находятся в силиях, и без силий этот сигнальный путь не работает. Тогда возникла гипотеза, что силии - это такие антенны. Которые участвуют в сигнализаровании. Народ стал искать, а не находятся ли другие компоненты других сигнальных путей в силиях? Но кроме ежового ничего до сих пор найти не может!
То есть они изо всех сил продолжают искать и высасывают из пальца разные аргументы, что силии участвуют в разных сигнальных путях (таких статей сейчас вышло уже тысячи, что "силии регулируют то-то и то-то") - но ни один из этих и близко не стоит к ежовому. С ежовым там всё очень понятно: компоненты локализуются прямо в силию, там внутри происходит их обработка, а если силии удалить, то эта обработка происходит не будет, и всё сломается. И когда силии удаляют у мышей, то эмбрионы гибнут именно потому, что ежовый пасвэй не работает. В первую очередь. Ни для одного другого сигнального пути подобного эффекта нет.
Но гипотеза того, что силии - это антенны, все равно сохраняется по сей день. Более того, поскольку народ активно пишет статьи, что силии "участвуют тут и там", то в эту гипотезу начинает верить все больше и больше народу. Хотя никаких крупных доказательств, кроме ежового пасвэя, до сих пор нет. Более того, существуют мыши, у которых силии были удалены только в тех клетках, где нет ежового пасвэя, и никаких проблем у этих мышей нет! Т.е. нет фенотипа. Ну или он есть, но не заметен. А силии, между тем, существуют во всех клетках! Абсолютно всех, кроме жировых и крови.
Поэтому вот для меня лично это загадка: что же они там делают, а? Там же нет ежового пасвэя.
Ответить на этот вопрос точно можно только одним способом: выяснив молекулярный состав силий. Вот если бы мы знали точно, ЧТО есть внутри силий, мы бы сразу могли сказать, какова их функция. Например, если мы там обнаружили бы юбиквитиназы, то мы бы знали, что там происходит юбиквитинирование какого-то протеина, которое должно быть по времени приурочено к существованию силий в клетке. Это стандартный принцип компартментализации. Что-то должно происходить где-то, чтобы оно было по времени и пространству к чему-нибудь приурочено. То есть если бы мы знали состав силий, все было бы значительно проще.
Однако! Состав силий определить до сих пор никому не удавалось. Долгое время силии пытались оторвать руками (точнее, наконечником пипетки - всосать и оторвать, patch clamp кто в теме), потом это удалось одной команде, они опубликовались в нейчер, и опубликовали состав оторванной силии. Однако в этом исследовании была огромная проблема: они оторвали силию "с мясом". То есть с центросомой, и со всем, что там на центросоме налипло соответственно. А это, сами понимаете, не то что нам нужно. На центросому там пол-клетки налипнет, тока дай.
Другие группы центрифугировали клетки и получали осадок из оторвавшихся силий, однако и в этом случае силии отрывались с мясом! Что кстати тоже интересно - значит, миктротрубочки внутри силиий прочнее, чем микротрубочки, идущие от центросом внутрь клетки - т.к. центросомы всегда вырываются с мясом.
Эти команды опубликовали протеомы силий и разные другие анализы, но в тех анализах присутствовало все, угодно, вплоть до РНК. И сказать, насколько это действительно относится к функции силий, не представлялось возможным.
И до сих пор ни один человек на свете не смог оторвать или отрезать только кончик силии, чтобы выяснить наконец, что в нем находится БЕЗ контаминации посторонним налипшим на центросоме материалом. И мы, увы, не можем наверняка сказать, какие на самом деле функции у этой таинственной органеллы, которая то ли антенна, то ли гигантский ус, и которая присутствует везде, но не дает фенотипа при удалении ее из большой части клеток во взрослых мышах.
Вот!!!
Оооо, силии я обожают и могу говорить про них часами)))) Они не моя центральная тема, я их просто очень люблю и постоянно ими занимаюсь в качестве подсобных бэк-ап проектов. С силиями такая фигня, что в общем сначала они были открыты как бесполезные отростки, и считались ненужными, впроде как аппендикс когда-то. А потом был открыт ежовый сигнальный путь (Hh), и выяснилось, что компоненты этого пути находятся в силиях, и без силий этот сигнальный путь не работает. Тогда возникла гипотеза, что силии - это такие антенны. Которые участвуют в сигнализаровании. Народ стал искать, а не находятся ли другие компоненты других сигнальных путей в силиях? Но кроме ежового ничего до сих пор найти не может!
То есть они изо всех сил продолжают искать и высасывают из пальца разные аргументы, что силии участвуют в разных сигнальных путях (таких статей сейчас вышло уже тысячи, что "силии регулируют то-то и то-то") - но ни один из этих и близко не стоит к ежовому. С ежовым там всё очень понятно: компоненты локализуются прямо в силию, там внутри происходит их обработка, а если силии удалить, то эта обработка происходит не будет, и всё сломается. И когда силии удаляют у мышей, то эмбрионы гибнут именно потому, что ежовый пасвэй не работает. В первую очередь. Ни для одного другого сигнального пути подобного эффекта нет.
Но гипотеза того, что силии - это антенны, все равно сохраняется по сей день. Более того, поскольку народ активно пишет статьи, что силии "участвуют тут и там", то в эту гипотезу начинает верить все больше и больше народу. Хотя никаких крупных доказательств, кроме ежового пасвэя, до сих пор нет. Более того, существуют мыши, у которых силии были удалены только в тех клетках, где нет ежового пасвэя, и никаких проблем у этих мышей нет! Т.е. нет фенотипа. Ну или он есть, но не заметен. А силии, между тем, существуют во всех клетках! Абсолютно всех, кроме жировых и крови.
Поэтому вот для меня лично это загадка: что же они там делают, а? Там же нет ежового пасвэя.
Ответить на этот вопрос точно можно только одним способом: выяснив молекулярный состав силий. Вот если бы мы знали точно, ЧТО есть внутри силий, мы бы сразу могли сказать, какова их функция. Например, если мы там обнаружили бы юбиквитиназы, то мы бы знали, что там происходит юбиквитинирование какого-то протеина, которое должно быть по времени приурочено к существованию силий в клетке. Это стандартный принцип компартментализации. Что-то должно происходить где-то, чтобы оно было по времени и пространству к чему-нибудь приурочено. То есть если бы мы знали состав силий, все было бы значительно проще.
Однако! Состав силий определить до сих пор никому не удавалось. Долгое время силии пытались оторвать руками (точнее, наконечником пипетки - всосать и оторвать, patch clamp кто в теме), потом это удалось одной команде, они опубликовались в нейчер, и опубликовали состав оторванной силии. Однако в этом исследовании была огромная проблема: они оторвали силию "с мясом". То есть с центросомой, и со всем, что там на центросоме налипло соответственно. А это, сами понимаете, не то что нам нужно. На центросому там пол-клетки налипнет, тока дай.
Другие группы центрифугировали клетки и получали осадок из оторвавшихся силий, однако и в этом случае силии отрывались с мясом! Что кстати тоже интересно - значит, миктротрубочки внутри силиий прочнее, чем микротрубочки, идущие от центросом внутрь клетки - т.к. центросомы всегда вырываются с мясом.
Эти команды опубликовали протеомы силий и разные другие анализы, но в тех анализах присутствовало все, угодно, вплоть до РНК. И сказать, насколько это действительно относится к функции силий, не представлялось возможным.
И до сих пор ни один человек на свете не смог оторвать или отрезать только кончик силии, чтобы выяснить наконец, что в нем находится БЕЗ контаминации посторонним налипшим на центросоме материалом. И мы, увы, не можем наверняка сказать, какие на самом деле функции у этой таинственной органеллы, которая то ли антенна, то ли гигантский ус, и которая присутствует везде, но не дает фенотипа при удалении ее из большой части клеток во взрослых мышах.
Вот!!!
