Нет, они с краю размазывательной площади. Это может и в центре тарелки находиться. Например, есть у меня круглая пластмассовая тарелка а-ля (http://postimg.org/image/hjtgt0ux3/)
Такую тарелку я делю на два (провожу маркером черту посередине даже). Потом на одной половине размазываю контрольный образец (не дает колоний), а на второй - опытный. И бактерии оказываются мелкие в середине того места, по которому размазаны, но крупные по краям. Технически так как "край" опытного размазывания будет находиться на границе, т.е. в середине тарелки, то они получаются крупные в середине тарелки. Т.е. это не из-за температуры или воздуха или чего-то такого.
Два чисто умозрительных предположения: 1 Изначально они были помещены в центр, там уже отжили и частично передохли, либо переели питательную среду. Как грибные кольца. 2. На краях больше питательной среды и больше места для развития.
Ну вот такая у меня картина. (http://postimg.org/image/itiogp583/)
То есть они не по краям тарелки, а по краям той области, на которую нанесены. Причем это независимо от области. Если тарелку поделить на три части, то будет по краям одной трети. А если на целую наносить, то по краям тарелки. Загадко.
Если бы это были клетки, то можно предположить такое. Но бактерии намного меньше, у них отсутствуют подобные механизмы пересылки сигналов на расстояния и получения этих сигналов, и помимо того это сухой медиум, а не жидкий, поэтому общение между этими колониями маловероятно. Хотя, в общем, не невозможно. Но все равно непонятно, почему размер колоний увеличен по краям, хотя вроде расстояние примерно одинаковое везде.
Увеличенный размер колоний - это значит, что в такой колонии бактерий больше, чем в маленькой. То есть это значит, что они либо быстрее растут, либо начали расти раньше (т.к. они удваиваются примерно каждые 20 мин). Почему бы бактерии в середине нанесенного пятна могли в принципе начать расти позже??
Меня учили, что каждая колония - это куча клонов одной-единственной начальной бактерии. То есть в начале была одна бактерия. Как при таком раскладе может получиться разновременной старт вообще?? Сижу и не могу ничо понять.
Может, это эффект высыхания? Есть интересное наблюдение, что когда капля кофе на столе высыхает, то бОльшая часть кофе остается по краям. Это вызвано течением внутри высыхающей капли.
Однако это не объясняет разницу в размерах колонии. С другой стороны, я совершенно не могу оценить вероятность того, что некоторые колонии сформированы из нескольких разных клонов.
Хм... если допустить, что им изначально нужна жидкость, в которой они растворены когда наносятся, и эта жикость высыхает в центре раньше, чем с краев, и поэтому они в центре активнее дохнут... не знаю, может это и имеет смысл. Но с другой стороны, растут же они потом, после полного высыхания как-то... не знаю.
Я не об этом. Пока жидкость не высохла, бактерии могут сноситься к краям пятна. По идее результатом этого будет, что по краям колоний больше. Но вот отчего сами колонии больше по размеру, мне неочевидно тоже. Возможно наличие жидкости изменяет скорость роста? Есть ли разница в скорости роста в жидкой среде и в твердой?
Да, по идее тогда результатом была бы большая плотность колоний по краям, чем в середине. А она одинаковая. Скорость роста вроде как одинаковая в жидкой и твердой.
А в суспензии изначально были клетки, неспособные расти на этой среде? Если, скажем, это трансформанты, то мое предположение такое: в центре больше плотность клеток, при этом при высеве все клетки пытаются расти, включая тех, у кого нет маркера. Они активно жрут питательные вещества, но всё равно умирают. Позитивным клонам в центре достается в среднем меньше, чем таким же на периферии, поэтому они растут медленнее.
Да, это трансформанты. В целом при посеве у меня действительно много жидкости остается в середине, большая такая капля. Можно каплю попробовать целенаправленно оставлять в разных местах и проверить... в следующий раз попробую.
Действительно, посмотрела вчерашнепосаженные тарелки, там четко видно, что наиболее мелкие колонии вырастают в том месте, где оставалось наибольшее количество жидкости (и, по-видимому, бактерий). Вероятно, так оно и есть.
Обычно такое не возникает, если "правильно" сажать, то есть там, растить в медиуме, потом отжимать, размазывать ровно 100 микролитров... но мне сильно влом так делать, потому что и без того у меня все работает, а не надо пытаться починить то, что и так работает(с).
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png)
timeasmymeasure
no subject
Date: 2014-01-07 08:27 am (UTC)no subject
Date: 2014-01-07 10:13 am (UTC)Такую тарелку я делю на два (провожу маркером черту посередине даже). Потом на одной половине размазываю контрольный образец (не дает колоний), а на второй - опытный. И бактерии оказываются мелкие в середине того места, по которому размазаны, но крупные по краям. Технически так как "край" опытного размазывания будет находиться на границе, т.е. в середине тарелки, то они получаются крупные в середине тарелки. Т.е. это не из-за температуры или воздуха или чего-то такого.
no subject
Date: 2014-01-07 08:59 am (UTC)1 Изначально они были помещены в центр, там уже отжили и частично передохли, либо переели питательную среду. Как грибные кольца.
2. На краях больше питательной среды и больше места для развития.
no subject
Date: 2014-01-07 10:24 am (UTC)То есть они не по краям тарелки, а по краям той области, на которую нанесены. Причем это независимо от области. Если тарелку поделить на три части, то будет по краям одной трети. А если на целую наносить, то по краям тарелки.
Загадко.
no subject
Date: 2014-01-07 12:24 pm (UTC)no subject
Date: 2014-01-07 10:57 am (UTC)no subject
Date: 2014-01-07 02:38 pm (UTC)Увеличенный размер колоний - это значит, что в такой колонии бактерий больше, чем в маленькой. То есть это значит, что они либо быстрее растут, либо начали расти раньше (т.к. они удваиваются примерно каждые 20 мин). Почему бы бактерии в середине нанесенного пятна могли в принципе начать расти позже??
Меня учили, что каждая колония - это куча клонов одной-единственной начальной бактерии. То есть в начале была одна бактерия. Как при таком раскладе может получиться разновременной старт вообще?? Сижу и не могу ничо понять.
no subject
Date: 2014-01-07 02:59 pm (UTC)Однако это не объясняет разницу в размерах колонии. С другой стороны, я совершенно не могу оценить вероятность того, что некоторые колонии сформированы из нескольких разных клонов.
no subject
Date: 2014-01-07 03:11 pm (UTC)no subject
Date: 2014-01-07 03:40 pm (UTC)no subject
Date: 2014-01-08 01:16 am (UTC)Скорость роста вроде как одинаковая в жидкой и твердой.
no subject
Date: 2014-01-07 03:41 pm (UTC)no subject
Date: 2014-01-08 01:20 am (UTC)no subject
Date: 2014-01-08 10:03 am (UTC)Вероятно, так оно и есть.
Обычно такое не возникает, если "правильно" сажать, то есть там, растить в медиуме, потом отжимать, размазывать ровно 100 микролитров... но мне сильно влом так делать, потому что и без того у меня все работает, а не надо пытаться починить то, что и так работает(с).